Las configuraciones del programa se guardan en un archivo localizado en el directorio personal de cada usuario, con el nombre de .pinerc.
La libreta de direcciones con todos los contactos que se tengan, se almacenan en un archivo llamado .addressbook.
Finalmente, la firma que se haya personalizado, se almacena en un archivo con nombre .signature
También es bueno recordar que las carpetas con los mensajes almacenados (exceptuando INBOX) se guardan en el directorio personal, en un subdirectorio llamado mail/.
A la hora de hacer respaldo de la correspondencia electrónica, es bueno conocer estos datos. Otro punto interesante a nombrar es que el pine, cada fin de mes preguntará al usuario si quiere mover las carpetas saved-messages y sent-mail a otro lugar, para ir almacenando solamente los mensajes del mes actual, es una buena práctica ir guardando los mensajes viejos en otro sitio, así el pine no tarda tanto tiempo al intentar abrir una carpeta que tiene miles de mensajes acumulados a través de los meses o años.